Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Meis1Q60954 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis1Q60954 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis1Q60954 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis1Q60954 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis1Q60954 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis1Q60954 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis1Q60954 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis1Q60954 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis1Q60954 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis1Q60954 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis1Q60954 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis1Q60954 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis1Q60954 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis1Q60954 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Meis1Q60954 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms