Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Neurod1Q60867 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Neurod1Q60867 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms