Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf4Q60793 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf4Q60793 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms