Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms