Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf3Q60765 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atf3Q60765 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atf3Q60765 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms