Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc5a6Q5U4D8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms