Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scaf1Q5U4C3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf1Q5U4C3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms