Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms