Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1dQ5SYD0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1dQ5SYD0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms