Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms