Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbs12Q5SUD9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms