Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam71bQ5STT6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam71bQ5STT6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam71bQ5STT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms