Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms