Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TefmQ5SSK3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms