Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlha9Q5RJB0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms