Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv4Q5R1A3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms