Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trim41Q5NCC3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Trim41Q5NCC3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trim41Q5NCC3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Trim41Q5NCC3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms