Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810065E05RikQ5NC41 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1810065E05RikQ5NC41 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1810065E05RikQ5NC41 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms