Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkaa1Q5EG47 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms