Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms