Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Spag9Q58A65 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Spag9Q58A65 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Spag9Q58A65 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Spag9Q58A65 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms