Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prune2Q52KR3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prune2Q52KR3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms