Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms