Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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