Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Krtap1-4Q3V2D6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms