Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmub2Q3V209 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmub2Q3V209 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms