Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd5Q3V1H9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms