Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp4r3cQ3V0Y1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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