Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr7Q3V0I2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms