Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrfip1Q3UZ39 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms