Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms