Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thsd4Q3UTY6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms