Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms