Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd27Q3UMR0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms