Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrch2Q3UMG5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms