Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc33Q3ULW6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc33Q3ULW6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms