Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpr55Q3UJF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms