Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms