Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms