Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtcl1Q3UHU5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtcl1Q3UHU5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms