Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Greb1Q3UHK3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms