Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6cQ3UHC0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms