Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5113Q3UGK8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5113Q3UGK8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5113Q3UGK8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms