Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil3Q3UFQ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil3Q3UFQ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms