Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnft2Q3UF64 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft2Q3UF64 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms