Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc10a4Q3UEZ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc10a4Q3UEZ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc10a4Q3UEZ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc10a4Q3UEZ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc10a4Q3UEZ8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc10a4Q3UEZ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc10a4Q3UEZ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms