Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms