Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Parp8Q3UD82 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Parp8Q3UD82 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Parp8Q3UD82 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Parp8Q3UD82 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Parp8Q3UD82 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Parp8Q3UD82 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Parp8Q3UD82 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Parp8Q3UD82 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms