Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip13Q3UA06 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms