Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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